Lutz Jäncke hat über 350 wissenschaftliche Arbeiten in peer-reviewed Zeitschriften verfasst. Er ist Autor und Herausgeber mehrerer Bücher und Buchkapitel und seine wissenschaftlichen Arbeiten zählen zu den 1% der am häufigsten zitierten Arbeiten weltweit. Ein besonderer Schwerpunkt seiner Forschung ist die Erforschung der neuronalen Grundlagen der Musikverarbeitung. 2007 erhielt er den Credit Swiss Teaching Award for Best Teaching an der Universität Zürich. 2006 und 2008 erhielt er jeweils die Goldene Eule der Studentenschaft der ETH Zürich für hervorragendes Lehren.

Arbeitet im Bereich der funktionellen Neuroanatomie und der kortikalen Plastizität im Zusammenhang mit dem Lernen. 

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